《神奇寶貝特別篇》是神奇寶貝的漫畫中最受歡迎的一部。劇本由日下秀憲編寫,,漫畫由真斗(1~9)和山本智(10~)所作畫。
故事情節主要是跟隨神奇寶貝的主線遊戲(從最初的「紅.綠」版開始)進行的。這個漫畫最大特點之一,每個主角分別對應任天堂所推出電玩版本(小藍算特例,小藍雖然是對應藍版,但藍版遊戲中並未有女主角。不過任天堂其實已經有構思過小藍的造型,遊戲中是在火紅.葉綠版才登場。
另外,火紅.葉綠版男主角則和紅、綠版一樣為小智和小茂,心金.魂銀版則同為阿金和阿銀。)。這個代表角色不只是遊戲中的登場人物,更有些(如小洛、米拉特)是《神奇寶貝特別篇》的原創角色(當然,還是以遊戲登場角色為多)。隨著版本增多,主角也會越來越多。
故事的每一回標題幾乎都是《VS XXX(XXX是某幾隻神奇寶貝)》(第三、四、六章的最終決戰與第五章除外)。此外,故事雖然是以遊戲情節為藍本,但對於神奇寶貝的對戰、世界觀以及情節等等卻有著一套自己的系統(和動畫、電玩的設定有不少出入)。
雖然同樣以神奇寶貝為主角,人物也有不少重複,但特別篇可以說完全以戰鬥為主題,結構較為嚴謹,相較動畫走輕鬆路調,這是兩者最大的不同之處。
(以上資料轉自中文維基百科全書)
特別篇主角版本對應圖: